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肾小管上皮调控元件中的变异介导人类肾功用遗传差异的大部分—小柯机器人—科学网
2022-04-30 17:32:43       来源:乐鱼官网

  本期文章:《天然—遗传学》:Online/在线日,《天然遗传学》杂志在线宣布了美国科学家的一项最新研讨成果。来自加州大学旧金山分校Jeremy F. Reiter等研讨人员协作发现,肾小管上皮调控元件中的变异介导人类肾功用遗传差异的大部分。

  研讨人员对英国生物样本库中406504名个别进行了全基因组相关研讨(GWAS),判定出影响中年成人肾功用的430个基因位点。为了研讨这些基因位点影响的细胞类型,研讨人员将GWAS与经过单细胞转座酶可接近染色质测序(scATAC-seq)判定的人类肾候选顺式调控元件(cCRE)进行了整合。

  总体上,56%的肾功用遗传力定坐落肾小管上皮cCRE,别的7%定坐落肾小囊足细胞cCRE。因而,成人肾功用的大多数遗传差异是由这两种细胞类型中基因表达的改动所引起的。

  经过增强子剖析、等位基因特异性scATAC-seq和机器学习,研讨人员发现许多肾功用变异改动了肾小管上皮cCRE的染色质可及性和功用。使用CRISPRi技能,研讨人员确认了一些cCRE调控的基因,提醒了NDRG1、CCNB1和STC1在调控人类肾功用中的效果。

  据了解,肾功用衰竭,即肾功用下降至无法保持生命的阈值以下,是导致发病率和死亡率的根本原因。

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